Hoewel de Comfy Nest CN-06160 veel goeds biedt, zijn er ook duidelijke nadelen en beperkingen waarmee je rekening moet houden. Ten eerste is het formaat: de 8 liter inhoud brengt een aanzienlijke afmeting en gewicht met zich mee. Voor kleinere keukens of gebruikers die het apparaat vaak willen opbergen kan dit onhandig zijn. De grote binnenruimte heeft ook een keerzijde: wanneer je de mand erg vol laadt, kan de luchtcirculatie minder efficiënt zijn, waardoor sommige delen van het gerecht minder krokant worden en je tussentijds moet schudden of draaien.
Een ander aandachtspunt is dat hoewel de digitale bediening modern oogt, touchbedieningen soms gevoelig zijn voor vette vingers en bedienen met natte handen lastiger kan zijn. Er worden geen extra accessoires zoals rekjes of bakvormen standaard meegeleverd, waardoor je beperkt bent tot de basismand en -lade. Voor wie uitgebreide bak- of grillfuncties wil uitbreiden, betekent dat extra aanschafkosten.
Daarnaast kan het geluid van de luchtcirculatie en de ventilator, vooral op hogere temperaturen, duidelijker aanwezig zijn dan bij een conventionele oven. Tot slot rapporteren sommige gebruikers een lichte geur tijdens de eerste gebruiksbeurten (productrook of verpakkingsresten) die verdwijnt na een paar keer draaien; dit is niet ernstig, maar het blijft een punt om rekening mee te houden.